药物化学（Medicinal chemistry）是利用化学的概念和方法发现确证和开发药物，从分子水平上研究药物在体内的作用方式和作用机理的一门学科。作为专业，是2011年新增的本科专业，研究任务包括：研究药物的化学结构和活性间的关系（构效关系）；药物化学结构与物理化学性质的关系；阐明药物与受体的相互作用；鉴定药物在体内吸收、转运、分布的情况及代谢产物；通过药物分子设计或对先导化合物的化学修饰获得新化学实体创制新药。
全国共有20所招收药物化学专业研究生的学校参与了排名，其中排名的是中国药科大学，排名第二的是北京大学，排名第三的是四川大学，以下是药物化学专业考研学校排名具体名单：
| 学校排名 | 学校名称 |
| 1 | 中国药科大学 |
| 2 | 北京大学 |
| 3 | 四川大学 |
| 4 | 中国海洋大学 |
| 5 | 沈阳药科大学 |
| 6 | 浙江工业大学 |
| 7 | 中山大学 |
| 8 | 山东大学 |
| 9 | 天津大学 |
| 10 | 复旦大学 |
| 11 | 中南大学 |
| 12 | 华中科技大学 |
| 13 | 南方医科大学 |
| 14 | 郑州大学 |
| 15 | 浙江大学 |
| 16 | 南京大学 |
| 17 | 上海交通大学 |
| 18 | 首都医科大学 |
| 19 | 吉林大学 |
| 20 | 安徽医科大学 |
